Les cancers épithéliaux de l’ovaire sont hétérogènes sur les plans histocliniques et moléculaires. Malgré les progrès thérapeutiques récents et une prise en charge pluridisciplinaire, la survie à 5 ans reste inférieure à 40 % [ 1]. Le cystadénocarcinome séreux (CAS) est la forme histologique la plus fréquente (70  %). Le carcinome à cellules claires (CCC) représente 10 à 12 % des cas et correspond à l’une des formes les plus agressives en raison de sa faible chimiosensibilité [ 2, 3]. Peu étudié au niveau moléculaire, il présente moins d’instabilité chromosomique que le CAS de haut grade. Le carcinome endométroïde (CE), retrouvé dans environ 15 % des cas, a un pronostic plus favorable que les précédents. Les CCC et CE se développent souvent sur une lésion bénigne, l’endométriose, dont les mécanismes moléculaires de transformation sont peu connus [ 4].

Jusqu’à présent, les altérations les plus fréquemment rapportées dans le CCC concernaient des mutations de gènes impliqués dans l’oncogenèse en général (CTNNB1 qui code la β-caténine, KRAS, PIK3CA [phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit α] et TP53) et l’amplification de la région chromosomique 20q13.2 [ 5, 6]. Deux études récentes basées sur le séquençage du génome tumoral décrivent des mutations somatiques du gène ARID1A (AT-rich interactive domaincontaining protein 1A), qui jouerait ainsi un rôle de gène suppresseur de tumeurs (GST) [ 7, 8]. Le gène ARID1A code BAF250a (BRG1-associated factor), un composant crucial du complexe SWI/SNF de remodelage de la chromatine.

La première équipe [7] a étudié l’ensemble des séquences codantes de huit CCC de l’ovaire, et trouvé 268 mutations somatiques réparties sur 253 gènes, dont 4 étaient mutés dans plus d’une tumeur : deux oncogènes (KRAS, PIK3CA), un oncogène potentiel (PPP2R1A, serine/ threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit Aα), et le gène ARID1A. Ces mutations ont été confirmées par séquençage direct de 34 autres CCC et 7 lignées cellulaires. Au total, ARID1A était muté dans 57 % des tumeurs et 71 % des lignées. Parmi les 32 mutations différentes d’ARID1A réparties sur l’ensemble du gène (Figure 1), 9 créaient des codons stop et 23 étaient des insertions/délétions conduisant à une rupture du cadre de lecture et, a priori, à la synthèse d’une protéine tronquée. Dans 42 % des tumeurs porteuses de mutations, l’inactivation d’ARID1A était bi-allélique, soit par mutation sur les deux allèles, soit par mutation de l’un et perte de l’autre.

Figure 1 Mutations du gène ARID1A détectées dans les carcinomes à cellules claires de l’ovaire et les carcinomes endométrioïdes. Schéma de la protéine BAF250a (sont indiquées les régions correspondantes aux 20 exons du gène ARID1A) avec ses différents domaines : un domaine ARID liant spécifiquement des séquences d’ADN riches en AT (en jaune), un domaine HIC1 (en orange) et des motifs LXXLL riches en leucine permettant l’interaction avec des récepteurs nucléaires (en gris). En bleu sont représentées les mutations non-sens, en rose les mutations de type frame-shift (insertion/délétion), et en vert les mutations faux-sens. En gris, les carcinomes à cellules claires et en orange les carcinomes endométrioïdes.

Figure 1 Mutations du gène ARID1A détectées dans les carcinomes à cellules claires de l’ovaire et les carcinomes endométrioïdes. Schéma de la protéine BAF250a (sont indiquées les régions correspondantes aux 20 exons du gène ARID1A) avec ses différents domaines : un domaine ARID liant spécifiquement des séquences d’ADN riches en AT (en jaune), un domaine HIC1 (en orange) et des motifs LXXLL riches en leucine permettant l’interaction avec des récepteurs nucléaires (en gris). En bleu sont représentées les mutations non-sens, en rose les mutations de type frame-shift (insertion/délétion), et en vert les mutations faux-sens. En gris, les carcinomes à cellules claires et en orange les carcinomes endométrioïdes.

La deuxième équipe [8] a séquencé l’ARN complet de 19 CCC (18 tumeurs et une lignée cellulaire constituant le jeu d’identification), et trouvé 6 mutations somatiques d’ARID1A. La fréquence des mutations a ensuite été définie par séquençage dans les 18 tumeurs précédentes et dans 210 cancers ovariens incluant 101 CCC, 33 CE et 76 CAS (jeu de validation) et une autre lignée de CCC. ARID1A était muté dans 46 % des CCC, 30 % des CE et dans la lignée, mais dans aucun des cas de CAS, suggérant une forte association de ces mutations avec les cancers associés à l’endométriose. La perte d’expression de la protéine correspondante, ARID1A/BAF250a, évaluée en immunohistochimie sur 182 tumeurs (jeux d’identification et de validation) était corrélée à la présence d’une mutation : elle caractérisait 73 % des CCC et 50 % des CE mutés, mais seulement 10 % des cas non mutés. Cette perte d’expression était associée aux cancers développés sur une endométriose préexistante, car elle était retrouvée dans 42 % des CCC et 21 % des CE, mais seulement 1 % des CAS. Cette corrélation a été confirmée sur une série de 455 cancers de l’ovaire incluant les 3 types histologiques. Pour deux CCC mutés, des échantillons d’endométriose juxta-tumorale et à distance de la tumeur étaient disponibles. Dans les deux cas, la mutation d’ARID1A et la perte d’expression de la protéine étaient présentes dans l’endométriose atypique juxta-tumorale, mais pas dans l’endométriose typique à distance, suggérant que la mutation est un événement précoce de l’oncogenèse.

Des délétions dans la région 1p35-36 qui porte le gène ARID1A ont été décrites dans divers cancers, suggérant la présence d’un ou plusieurs gènes suppresseurs de tumeurs. Aucune mutation d’ARID1A n’avait jusqu’alors été décrite en dehors de réarrangements chromosomiques l’impliquant dans le cancer du sein et des lignées cellulaires de cancer du poumon [ 9]. La perte d’expression de BAF250a avait été observée dans les lignées de cancers du col de l’utérus et du sein. ARID1A code pour une sous-unité du complexe de remodelage de la chromatine SWI/SNF (Figure 2). Ce complexe, présent chez tous les eucaryotes, intervient dans le développement, la différenciation, la prolifération, la réparation d’ADN et joue un rôle suppresseur de tumeurs. L’activité hélicase et ATPase d’ARID1A/BAF250a permet la régulation de la transcription de certains gènes par altération de leur structure chromatinienne. La protéine possède des domaines conservés. Le premier lui permet de lier spécifiquement des séquences d’ADN riches en AT reconnues par le complexe SWI/SNF. Un deuxième, carboxy-terminal, permet l’activation transcriptionnelle de cibles du récepteur des glucocorticoïdes. La protéine confèrerait ainsi au complexe SWI/SNF une spécificité pour le recrutement des gènes cibles. ARID1A/BAF250a possède aussi une boîte BC et intervient dans un complexe ubiquitine ligase E3 [ 10]. Ses fonctions dans l’oncogenèse restent à préciser.

Figure 2 Schéma fonctionnel du rôle du complexe SWI/SNF et de sa sous-unité ARID1A.. Ils activent la transcription de gènes cibles via la fixation au récepteur des glucocorticoïdes (GR), entraînant une modulation de la chromatine.

Figure 2 Schéma fonctionnel du rôle du complexe SWI/SNF et de sa sous-unité ARID1A.. Ils activent la transcription de gènes cibles via la fixation au récepteur des glucocorticoïdes (GR), entraînant une modulation de la chromatine.

Les mutations et la perte d’expression de la protéine dans les lésions précancéreuses endométriosiques atypiques [8] suggèrent que l’inactivation d’ARID1A interviendrait précocement dans la transformation de l’épithélium ovarien. La nature des mutations observées et leur profil suggèrent qu’ARID1A fonctionne comme un gène suppresseur de tumeur dans le CCC. La forte proportion de mutations bi-alléliques indique une inactivation en deux temps selon le modèle de Knudson¹. Pour faire un bon mot, on pourrait dire que ces formes sur endométriose sont des formes « ariditaires » de la maladie, bien distinctes des formes sans lésion précancéreuse identifiée. Deux types de cancer ovarien semblent se distinguer : le CAS de haut grade, avec instabilité génétique et mutations de TP53 et BRCA, et les carcinomes à cellules claires et endométrioïdes, sans instabilité génétique, mais avec mutation d’ARID1A et de la voie PI3 kinase.

D’une manière plus générale, il est frappant de constater que de nombreux gènes récemment impliqués dans l’oncogenèse, comme ASXL1 (additional sex combs-like protein 1), EZH2 (enhancer of zeste homolog 2, qui code une histone-méthyltransférase), JARID1C (Jumonji/ARID domain-containing protein 1C), TET2 (ten-eleven-translocation, muté dans des hémopathies myéloïdes humaines [ 11]) ou UTX (ubiquitously transcribed X chromosome tetratricopeptide repeat protein), sont des régulateurs épigénétiques [ 12]. De nombreuses autres mutations vont certainement être trouvées parmi les membres de cette vaste famille. Une grande partie des dérégulations épigénétiques si fréquemment observées dans les cancers, voire peut-être toutes, seraient ainsi d’origine génétique.

Les auteurs déclarent n’avoir aucun conflit d’intérêts concernant les données publiées dans cet article.