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Med Sci (Paris). 2004 December; 20(12): 1149–1155.
Published online 2004 December 15. doi: 10.1051/medsci/200420121149.

Zoom sur l’excellence en recherche biomédicale en France

Lesya Baudoin, Céline Peltier, Claude Graillot-Gak, and Nicole Haeffner-Cavaillon*

Cellule de Bibliométrie, Département de l’Évaluation scientifique, Inserm, 101, rue de Tolbiac, 75654 Paris Cedex 13, France
Corresponding author.
 

La performance de la France dans le domaine de la recherche fait actuellement l’objet de nombreuses discussions. Les données bibliométriques issues des bases de publications et des observatoires scientifiques peuvent nous donner des éléments objectifs de comparaison. Une première approche se fonde sur la production scientifique de chaque pays soit en nombre de publications, soit en termes de « visibilité ou impact » mesurés par l’ensemble des citations. Les publications scientifiques françaises en 2001, tous domaines confondus, représentent un peu plus de 5 % du nombre de publications du monde et correspondent à 6,4 % des adresses répertoriées [ 1, 2]. Les résultats des différentes études bibliométriques convergent et montrent que la France occupe, en nombre absolu de publications, la 5e place dans le monde et la 3e place en Europe, après l’Angleterre et l’Allemagne. Ce classement est identique pour les recherches biomédicales1, et non biomédicales2, (Tableau I). Si l’on compare deux périodes, 1997-2001 et 1998-2002, le nombre de publications dans le monde progresse de 3,1 %. Dans le même temps, la part des publications de l’Europe des 15 augmente de 2,8 % et celles de l’Allemagne de 2,7 %, de la France de 1,6 %, des États-Unis de 1,5 % et du Royaume-Uni de 1,4 % [2]. Une analyse, toutes disciplines confondues, de la visibilité de la recherche par la communauté scientifique, mesurée par le nombre total de citations des dix dernières années, place également la France en 5e position mondiale et à la 3e place européenne. À noter que dans le domaine biomédical, elle occupe la 4e position mondiale et la 2e place européenne.

Mesurer l’excellence

Les publications scientifiques recouvrent deux réalités différentes, la nécessité de la communication vers les pairs et la nécessité du transfert de connaissance vers des utilisateurs qui ne font pas, stricto sensu, partie de la communauté scientifique. Les études qui se fondent uniquement sur le nombre total des publications - incluant celles publiées dans les revues nationales de faible notoriété à usage local ou didactique - ne s’appuient pas sur une mesure pertinente de la qualité scientifique. Cette dernière s’apprécie davantage par la capacité d’un pays de produire des travaux d’excellence dont l’impact permettra des avancées majeures.

Les articles les plus cités rapportent des découvertes exceptionnelles ou ayant un fort impact en terme de santé publique. À titre d’exemple, en médecine clinique, l’article le plus cité dans la période 1993-2003, est un essai thérapeutique, publié en 1995, sur la prévention des maladies cardiovasculaires. Il a reçu 3 109 citations 3 [ 3]. En biologie-biochimie, l’article le plus cité (excluant les descriptions de techniques) décrit la mise en évidence, en 1994, de la signalisation intracellulaire Jak-Stat par l’interféron. Il a été cité 2 346 fois 3 [ 4]. En sciences sociales-santé publique, l’article le plus cité (publié en 1994) a reçu 853 citations 3 [ 5]. Ces chiffres montrent la grande variabilité du nombre de citations en fonction des disciplines. Les articles extrêmement cités sont très rares, quelle que soit la discipline, et représentent moins de 0,01 % du nombre total des articles publiés.

La mesure de l’excellence dans le monde scientifique ne fait pas l’unanimité [ 68]. Pour les uns, elle inclut le retour sur investissement, les licences et brevets, le nombre de molécules en développement, pour les autres, le nombre de prix Nobel, des médailles prestigieuses, le nombre d’articles dans les revues à très fort facteur d’impact 4,(reflet de la sélectivité des éditeurs) et enfin le nombre d’articles au Top 1 % 5 (reflet de la participation aux grandes découvertes). Néanmoins, les prix ou la valorisation sont toujours précédés d’une production de connaissance et les publications d’excellence en sont le témoin le plus précoce et le plus fidèle. Une étude récente montre que l’analyse des citations permet d’identifier la très grande majorité des travaux significatifs et que le nombre d’articles dont la reconnaissance par les pairs a été négligée dans un premier temps est extrêmement faible [ 9]. La production des articles les plus cités permet donc de suivre au plus près l’excellence d’un pays (ou d’un institut). Nous avons donc choisi d’analyser la place de la France en fonction de deux critères complémentaires : le nombre d’articles publiés dans les journaux de grande notoriété dont les articles sont majoritairement cités et le nombre d’articles au Top 1 %.

Les États-Unis publient 70 % des articles 6, des journaux de très fort facteur d’impact 7 (supérieur à 20). Ils occupent la première place suivis par le Royaume-Uni (13,8 %), l’Allemagne (10,5 %), la France (7,3 %) et l’Italie (3,5 %). Si on évalue la capacité d’un pays à publier dans ces revues dites de prestige (nombre d’articles publiés dans les revues à fort facteur d’impact/nombre total d’articles), la France se situe toujours à la 4e place mondiale (0,54 %), très près du score de l’Allemagne (0,56 %) et du Royaume-Uni (0,60 %). Le score des États-Unis est plus élevé (0,83 %).

Il est également possible d’identifier, grâce à la base internationale de données de l’ISI 8, les travaux les plus cités (Top 1 %) par nation, par institution, par chercheur et ceci dans chaque domaine ou discipline. Le corpus identifié ainsi par l’ISI contient, pour la période 1993-2003, 73 280 articles toutes disciplines confondues. En nombre d’articles présents dans ce corpus, la France se situe à nouveau en 3e position dans l’Europe des 15 et à la 5e position mondiale. Les États-Unis ont 2 % de leurs articles au Top 1 %, l’Angleterre 1,5 %, l’Allemagne 1,3 %, la France 1,1 % et l’Italie 1 % (Figure 1).

Analyse du corpus d’excellence biomédical de la France

Pour la même période, 1993-2003, le corpus du Top 1 % biomédical mondial rassemble 30 700 publications. La sélection des articles ayant au moins une adresse française, permet d’identifier 1 866 publications (0,92 % de l’ensemble des publications de la France et 6,07 % du corpus). L’Allemagne en totalise 2 604 (0,96 % de sa production ; 7,54 % du corpus) et le Royaume-Uni 3 895 (1,29 % de sa production et 11,27 % du corpus) (Figure 1).

Le corpus de publications associées à la France rassemble plus de 14 000 auteurs, près de 4 000 structures de recherche (adresses différentes). Il émane d’un millier de villes (françaises et étrangères) et de 70 pays. Les articles qu’il contient, très cités, ont été publiés pour 27 %, dans des revues de grand prestige 7 et pour 73 % dans les journaux de spécialités. La moyenne de citations est d’environ 200 par article. Vingt sont cités plus de 1 000 fois et 65 % plus de 100 fois.

Le nombre de publications associées à la France dans le corpus Top 1 %, entre 1993 et 2001, s’accroît régulièrement. Cette évolution (70 %) est presque exclusivement due aux publications de médecine clinique. L’augmentation de la totalité des publications françaises dans la même période est de 40 %. Afin d’analyser plus finement les données françaises, d’identifier les disciplines majeures et les spécialités médicales les mieux représentées dans ce corpus d’excellence, un système d’indexation à trois niveaux : « grandes disciplines », « sous-disciplines » et « type de recherche », a été adopté. Chaque article n’a été assigné qu’à l’une des sept disciplines suivantes : biologie-biochimie, médecine clinique, génétique et biologie moléculaire, microbiologie (excluant les maladies infectieuses assignées à médecine clinique), neurosciences (incluant la psychiatrie, la psychologie, le comportement et la neurologie clinique) et santé publique. Bien que transversale, l’oncologie a été regroupée comme une spécialité unique de la médecine clinique.

Les articles de médecine clinique constituent le groupe le plus important du corpus (58 %). Ils ont été répartis en sous-disciplines. La plus représentée est l’oncologie (32 % des articles), suivie des maladies infectieuses (17 %), de la cardiologie et des maladies cardiovasculaires (14 %), puis des maladies rares (7 %). Les autres sous-disciplines représentent moins de 5 %. Pour ce qui concerne les types de recherche, 45 % des articles traitent des recherches fondamentales, 21 % des essais cliniques ou investigations cliniques, 13 % d’études épidémiologiques et moins de 5 % des techniques. Treize pour cent sont des revues de synthèse.

Répartition régionale
Selon les données de l’Observatoire des Sciences et de la technologie [1] l’Île-de-France est associée, en 2000, à 40 % des publications biomédicales françaises. Nos données indiquent qu’elle totalise plus de 50 % des publications au Top 1 % dans le même domaine. Paris (banlieues proches comprises) est majoritairement associée aux publications du Top 1 % (42 % des articles). La deuxième position revient à Lyon (10 %), suivi de Marseille (7 %), Lille (6 %), Strasbourg (5,5 %) et Toulouse (5 %). Pour les 15 villes analysées, le domaine le plus représenté est la médecine clinique. Le deuxième domaine varie selon les villes, génétique à Strasbourg, santé publique à Lyon, biologie-biochimie à Grenoble, neurosciences à Paris, Bordeaux, Montpellier et Marseille (Figure 2). L’analyse plus détaillée du domaine de la médecine clinique indique que dans toutes les villes, sauf Nancy, l’oncologie arrive en tête. Puis, selon les villes, maladies infectieuses ou cardiologie et maladies vasculaires sont en deuxième position. Lille est un site d’excellence pour les recherches en nutrition et sur le diabète ; Paris pour les maladies rares 9, Marseille et Nice pour les maladies infectieuses (Figure 3).
Collaborations internationales et nationales
Le degré de collaboration le plus élevé s’établit avec les États-Unis qui cosignent 36 % des articles du corpus Top 1 % de la France, puis avec le Royaume-Uni (21 %), l’Allemagne (16 %) et l’Italie (12 %). Il varie en fonction du type d’article : dans le cas des recherches fondamentales, les investigations cliniques et les essais cliniques de phases I et II, une grande part des travaux d’excellence sont issus d’équipes uniquement françaises (environ 50 %). En revanche, dans le cas des essais cliniques de phases III et IV, les équipes françaises sont insérées dans les réseaux internationaux d’excellence (80 % des articles sont issus de collaborations).

Le site Paris est plus associé à des villes étrangères qu’à des villes nationales avec un axe fort Paris-Londres (10 % des articles associés à Paris) suivi de Lyon, New York, Boston, Bruxelles, avant les autres villes françaises. Le site Lyon est associé à Paris puis à Londres et à Bethesda. Les autres grandes villes françaises copublient prioritairement avec Paris, puis avec d’autres sites régionaux. Les axes majeurs s’établissent entre Lyon et Marseille ou Toulouse, entre Strasbourg, Lyon et Marseille, entre Bordeaux, Lyon et Marseille donnant après Paris, un rôle clé à Lyon.

L’université et l’hôpital
La recherche biomédicale associe les acteurs du monde universitaire et hospitalier. Les centres hospitaliers et l’université vivent de longue date en symbiose et ils sont des acteurs majeurs dans le développement de la recherche clinique.

En région parisienne 10, le site de la Pitié-Salpêtrière (104 publications au Top 1 % - plus de 10 par an) est reconnu pour ses articles sur les maladies infectieuses, les neurosciences, les maladies rares, les maladies cardiovasculaires et l’oncologie. Le site Necker-Enfants Malades (93 publications) s’illustre par ses travaux sur les maladies rares, l’immunologie, les maladies infectieuses, l’oncologie et la néphrologie. Le site Saint-Louis (69 publications) a pour spécialités médicales majeures l’oncologie, la transplantation et le diabète. Le site de Cochin-Port Royal (57 publications) figure dans le Top 1 % pour ses articles sur les maladies infectieuses, les soins intensifs et les maladies osseuses (Figure 4).

En province, les sites des centres hospitalo-universitaires (CHRU) s’identifient majoritairement par deux spécialités médicales : l’oncologie et les maladies cardiovasculaires. Outre ces spécialités, le CHRU de Lyon (78 publications au Top 1 %) présente des travaux remarquables sur les maladies osseuses, l’hépatite infectieuse et l’immunologie. Le CHRU de Lille (54 publications) est reconnu pour ses travaux en nutrition, celui de Toulouse (45 publications au total) pour ses études en neurosciences, celui de Bordeaux (37 publications) pour ses études en gastro-entérologie (Figure 4).

Les organismes de recherche
Les organismes de recherche français très fortement impliqués dans la recherche biomédicale, l’Inserm, le CNRS (sciences du vivant) et l’Institut Pasteur, sont signataires de plus de la moitié des articles du Top 1 %. L’Inserm (593 publications) est en 1re position pour la recherche en médecine clinique, en neurosciences et en immunologie, le CNRS (520 publications) est en 1re position en biologie-biochimie et génétique-biologie moléculaire. L’Institut Pasteur (198 publications) est premier en microbiologie et maladies infectieuses. Les spécialités médicales phares de l’Inserm sont l’oncologie, les maladies infectieuses (toutes maladies confondues), les maladies rares et les maladies cardiovasculaires. Celles du CNRS sont l’oncologie, les maladies infectieuses et la pharmacologie-toxicologie. Environ 30 % des publications au Top 1 % du CNRS et de l’Inserm sont cosignées par les deux organismes. L’Institut Pasteur cosigne 40 % de ses articles au Top 1 % avec le CNRS et 35 % avec l’Inserm.
Conclusions

La communication scientifique est un phénomène socioculturel complexe, influencée par une multitude de facteurs d’ordre économique, sociétal, psychologique… La production des publications scientifiques est la « vitrine » la plus visible de ce processus et fait l’objet de nombreuses études bibliométriques. Les données bibliographiques y compris les citations deviennent facilement disponibles aujourd’hui grâce aux bases de données sur Internet. La facilité apparente de leur maniement peut conduire à utiliser des critères réducteurs ne mesurant qu’un paramètre pour en tirer des conclusions globales. Les experts en bibliométrie s’entendent sur la nécessité d’utilisation d’indicateurs multiples comme seul moyen d’approcher la réalité de façon adéquate [ 10]. Quels que soient les indicateurs utilisés, la France se situe parmi les grandes nations scientifiques. Elle est présente dans les travaux d’excellence et ses chercheurs contribuent aux grandes avancées de la science. Au cours de ces dix dernières années, un grand nombre de ses travaux a été publié dans les meilleurs journaux scientifiques et les découvertes ont été relayées par la communauté scientifique mondiale comme en attestent les citations reçues. Sa participation au corpus des articles d’excellence du Top 1 % et sa capacité de publier dans les journaux de plus haut niveau augmente régulièrement avec actuellement plus de 200 articles par an dans les revues prestigieuses et plus de 500 par an au Top 1 % dont près de 200 dans le domaine biomédical.

 
Footnotes
1 Biologie, génétique, neurosciences, immunologie, microbiologie, pharmacologie, toxicologie, médecine clinique, santé publique.
2 Mathématiques, physique, chimie, environnement, écologie, géosciences, ingénierie, sciences de l’agriculture, sciences de l’espace…
3 Citations en juin 2004.
4 Mesure du prestige du journal élaborée à partir du nombre moyen de citations de l’ensemble des articles sur une période de 2 ans.
5 Pour chaque année et chaque discipline, les publications mondiales sont classées par nombre de citations reçues ; ce classement permet ainsi d’identifier les articles les plus cités qui constituent le Top 1 %.
6 Les articles écrits en collaboration sont comptés pour chaque pays.
7 New England Journal of Medicine, Science, Nature, Nature Genetics, Nature Immunology, Nature Cell Biology, Cell (IF supérieur à 20) : 0,25 % des publications mondiales ; articles de 1999 à 2003.
8 Institut for Scientific Information : base qui indexe plus de 8 000 revues ; entre 1993 et 2003, elle contient plus de 9 millions d’articles qui ont obtenu près de 53 millions de citations à la date de juin 2004.
9 Indexées selon la classification Orphanet-maladies rares, génétiques ou avec une susceptibilité génétique.
10 Sites identifiés par au moins trois spécialités ayant au moins cinq articles dans le Top 1 %.
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