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Med Sci (Paris). 36(12): 1118–1128.
doi: 10.1051/medsci/2020241.

Le vieillissement
Une histoire de dommages de l’ADN, d’enveloppe nucléaire altérée et d’inflammation ?

Paula Fontanilla,** Simon Willaume,** Benoit Thézé,** Angela Moussa, Gaëlle Pennarun, and Pascale Bertrand*

Laboratoire Réparation et Vieillissement, Institut de radiobiologie cellulaire et moléculaire, Institut de biologie François Jacob, Direction de la recherche fondamentale du CEA, Unité 1274, Stabilité génétique, cellules souches et radiations CEA-Inserm-Universités Paris Diderot – Paris Saclay , 18 route du Panorama , 92265Fontenay-aux-Roses , France
Corresponding author.
**Contribution équivalente
*pascale.bertrand@cea.fr
 

Le vieillissement s’accompagne d’un nombre croissant de cellules sénescentes dans l’organisme. Ce processus participe à l’accumulation d’altérations fonctionnelles dans les tissus, menant à l’apparition de multiples maladies liées à l’âge [ 1 ]. Le phénomène de sénescence cellulaire a été décrit par Hayflick et Moorhead en 1961 comme étant un arrêt de la division cellulaire normale. Ces auteurs mirent en effet en évidence le caractère limité de la capacité mitotique des cellules normales humaines, introduisant ainsi le concept de sénescence réplicative. Depuis ces premières observations, la caractérisation de ce phénotype et de ses mécanismes d’induction par divers stress cellulaires a été largement précisée et nourrie par de nouvelles connaissances. La majorité des syndromes de vieillissement accéléré sont des maladies majoritairement associées à un défaut de signalisation ou de réparation des lésions à l’ADN ou à des défauts de structure de l’enveloppe nucléaire ( Figure 1A ) . Nous verrons qu’une caractéristique récurrente d’un grand nombre de situations d’induction de sénescence est la présence de dommages de l’ADN. En outre, la découverte du processus de sécrétion pro-inflammatoire des cellules sénescentes a permis d’établir un lien clair entre sénescence et vieillissement au niveau de l’organisme entier et d’appréhender les liens communs des maladies liées à l’âge.

Nous décrirons dans cette revue les caractéristiques et les mécanismes d’induction de la sénescence, ainsi que le phénotype sécrétoire et inflammatoire qui lui est associé. Nous discuterons du lien étroit existant entre l’altération des lamines, composants essentiels de l’enveloppe nucléaire et le vieillissement cellulaire. Nous verrons que l’altération de l’enveloppe nucléaire, comme celle observée dans la Progéria, est aussi associée à des défauts de réparation de l’ADN, à une persistance accrue de dommages de l’ADN et à un phénotype inflammatoire.

Caractéristiques des cellules sénescentes et rôle dans le vieillissement de l’organisme

L’existence de plusieurs programmes d’induction de la sénescence, selon le type cellulaire et les stimulus de stress subis, mène à une complexité du phénotype sénescent. Encore actuellement, les marqueurs permettant sa détection restent largement non spécifiques et ce n’est que l’observation conjointe de plusieurs caractéristiques associées à ce phénotype qui permet de conclure à un état de sénescence. Ainsi, la cellule sénescente est généralement caractérisée par une activation persistante de la réponse aux dommages de l’ADN. Cette dernière peut être mise en évidence par l’accumulation de cicatrices non résolues au niveau de l’ADN ( DNA scars ) révélées par les marqueurs de cassures d’ADN double-brin (CDB) sous forme de foyers de réparation g-H2AX et 53BP1 [ 2 ]. Toutefois, la persistance de dommages n’est pas spécifique de la sénescence. Cette dernière se caractérise principalement par le blocage persistant du cycle cellulaire, initié par la réponse aux dommages de l’ADN et contrôlé par la modulation d’inhibiteurs de kinases dépendantes des cyclines (CDKi). En particulier, la régulation des CDKi p16 INK4a et p21 Cip1 , l’activation des gènes suppresseurs de tumeurs p53 et pRb ( retinoblastoma protein ), le contrôle des voies mTOR ( mechanistic target of rapamycin ) et p38 MAPK ( mitogen-activated protein kinase ) participent à la mise en place du programme de sénescence [ 3 ] ( → ).

(→) Voir la Synthèse de J.M. Brondello et al ., m/s n° 3, mars 2012, page 288

L’analyse de l’expression de ces protéines, mais aussi l’incapacité de la cellule à incorporer les analogues de bases BrdU/EdU 1 au niveau de l’ADN, permet de déterminer l’arrêt « permanent » du cycle cellulaire associé à l’état de sénescence. Les cellules sénescentes développent également des capacités de résistance à l’apoptose, notamment en augmentant la quantité de protéines anti-apoptotique Bcl( B-cell lymphoma )-2, Bcl-w et Bcl-xL [ 4 ]. Cependant, leur niveau d’expression a rarement été utilisé comme marqueur.

Par ailleurs, la cellule en sénescence est caractérisée par une sécrétion accrue (nommée SASP pour senescence-associated secretory phenotype ) de facteurs inflammatoires et de remodelage tissulaire, tels que des cytokines, des chimiokines et des protéinases. Ce profil sécrétoire est très hétérogène et régulé par le facteur de transcription NF-kB ( nuclear factor-kappa B ) et la kinase p38 MAPK, eux-mêmes contrôlés par la réponse aux dommages à l’ADN, ainsi que par la voie de détection d’ADN dans le cytoplasme des cellules via le senseur cGAS. Les composants principaux du SASP (IL[interleukine]-1a, IL-1b, IL-6, IL-8, MMP-1 [ matrix metalloproteinase-1 ]) sont pro-inflammatoires, bien que d’autres médiateurs exprimés soient immunosuppresseurs (CXCL[ C-X-C motif chemokine ligand ] 1 et 2, GM-CSF [ granulocyte macrophage colony-stimulating factor ], M-CSF, IL-10, IL-13) [ 5 ]. La constitution du SASP est par ailleurs soumise à un contrôle spatial et temporel [ 6 ]. Le SASP confère à la sénescence un rôle parfois bénéfique dans la réparation et le remodelage tissulaire et parfois délétère dans de nombreuses pathologies inflammatoires et dans le développement du cancer. Il est ainsi proposé que la sénescence puisse avoir un rôle anti-tumoral, d’une part en bloquant la prolifération de cellules portant des dommages de l’ADN, potentiellement tumorigènes, et, d’autre part, en déclenchant l’immunité innée contre celles-ci. Cependant, au cours du vieillissement normal, l’accumulation de cellules sénescentes, associée à l’affaiblissement de la réparation de l’ADN et du système immunitaire engendrerait une inflammation chronique liée au SASP, qui pourrait rendre compte de la plupart des pathologies liées à l’âge, dont l’athérosclérose, l’arthrite, l’ostéoporose et le cancer ( Figure 1B ) . Cette opposition fonctionnelle de la sénescence au cours de la vie de l’organisme est en accord avec l’hypothèse de pléiotropie antagoniste décrite par George C. Williams en 1957 [ 7 ]. Le lien direct entre accumulation de cellules sénescentes et vieillissement de l’organisme a été proposé ou discuté par différentes équipes [ 3 , 8 ]. Enfin, plus récemment, les travaux de Baker et al. ont apporté la preuve de concept dans un modèle murin que l’élimination des cellules sénescentes induisait une diminution de différentes pathologies liées à l’âge [ 9 ]. Ces travaux justifient les recherches actives actuellement menées sur les mécanismes moléculaires associés à la sénescence et celles ayant pour but de découvrir des molécules sénolytiques, qui permettraient d’éliminer les cellules sénescentes au niveau de l’organisme [ 10 ].

Ces dernières années, il a été montré que les cellules sénescentes sont la cible de l’immuno-surveillance dans différents contextes physiologiques. Par ce mécanisme, le système immunitaire détecte et élimine les cellules sénescentes ainsi que les cellules (pré-) malignes, réduisant ainsi le risque de développer un cancer. La dérégulation de ce processus contribue à l’accumulation de cellules sénescentes dans l’organisme vieillissant. Récemment, il a été montré la perforine-1 joue un rôle essentiel pour limiter la charge tissulaire en cellules sénescentes tout au long du processus de vieillissement. Ainsi, une carence en perforine-1 est accompagnée d’une inflammation chronique et d’un vieillissement accéléré. La déficience en perforine-1 dans un modèle murin de la Progéria (LMNA +/G609G ) 2 , accélère le vieillissement prématuré et, remarquablement, le traitement par le sénolytique ABT-737 (mimétique BH3) réduit l’impact du vieillissement prématuré dans ce modèle [ 11 ]. Quelles sont les cibles reconnues par les cellules immunitaires exprimant la perforine-1 ?, Quel est le mécanisme exact d’action du sénolytique ABT-737 dans le modèle Progéria? Autant de questions qui nécessitent des recherches actives dans ce domaine de l’immunosurveillance [ 12 ]. L’immunosurveillance de la sénescence apparaît donc comme un facteur limitant du vieillissement ainsi que du développement tumoral.

Les cellules sénescentes présentent des modifications métaboliques, des aberrations structurelles et morphologiques (élargissement de la cellule), des changements de la composition de la membrane plasmique et une accumulation de mitochondries ainsi que de lysosomes. Cette augmentation d’activité lysosomale n’est pas nécessaire à l’induction de la sénescence, mais est facilement décelable par la quantification de la SA-bêta-galactosidase, un test classiquement utilisé pour mettre en évidence un phénotype sénescent. Des changements importants de l’organisation nucléaire sont également observés au cours de la sénescence, caractérisés par la présence de foyers d’hétérochromatine (SAHF) et, comme nous le verrons, par la dérégulation de la lamina nucléaire.

Mécanismes d’induction de la sénescence : le rôle pivot des dommages de l’ADN
Sénescence réplicative : rôle des télomères
La sénescence réplicative, observée par Hayflick en 1961, est liée au problème de réplication au niveau des extrémités des chromosomes. En effet, les ADN polymérases synthétisent l’ADN dans la direction 5’ vers 3’ et nécessitent une amorce afin de générer un brin néoformé à partir de la séquence de référence. Au niveau des extrémités télomériques, à chaque cycle réplicatif de la cellule, la partie terminale du brin dit retard ne pourra donc pas être copiée par l’ADN polymérase. Il en résulte un raccourcissement progressif des télomères à chaque cycle de division cellulaire. À partir d’un certain degré de raccourcissement des chromosomes, le complexe multi-protéiques appelé « Shelterin » peine alors à se former autour des télomères et la réponse aux dommages à l’ADN s’en trouve alors durablement activée. Ce complexe est en effet capital pour former la structure en boucle T ( T-loop ) des télomères et aussi pour empêcher les protéines de la réponse aux dommages de l’ADN de reconnaître l’extrémité des télomères comme une cassure double-brin. Le raccourcissement télomérique conduit à un arrêt du cycle cellulaire, à l’activation de mécanismes de réparation, mais aussi au déclenchement de la sénescence et des voies de mort cellulaire.
Sénescence induite par l’expression d’oncogènes
D’autres stimulus peuvent être responsables de l’induction de la sénescence, comme cela fut initialement montré par les travaux de Scott Lowe [ 13 ]. En effet, une activation chronique d’oncogènes (Ras, BRAF, etc.) ou encore l’inactivation de protéines suppresseurs de tumeurs (PTEN, RB, etc.) peuvent induire l’entrée en sénescence. La sénescence induite par l’expression d’oncogènes (OIS) a été décrite dans un premier temps comme ayant un rôle anti-tumoral.

L’OIS peut notamment être causée par des variants constitutivement actifs de la voie RAS/MAPK (H-RAS G12V , N-RAS Q61R , B-RAF V600E ), ainsi que par des variants de la voie PI3K (phosphoinositide 3-kinase)/AKT (protéine kinase B) (PIK3CA H1047R , AKT1 E17K , délétions ou mutations de PTEN) [ 14 ]. Dans le cas de la RIS ( RAS-induced senescence ), l’hyper-prolifération engendrée par la dérégulation de ces voies de signalisation contribue à générer un stress réplicatif (associé potentiellement à l’induction d’espèces réactives de l’oxygène) et à activer la réponse aux dommages de l’ADN [ 15 ]. Il en résulte l’activation des protéines ATM/ATR ( ataxia telangiectasia mutated / ataxia telangiectasia and Rad3-related protein ), la surexpression des protéines p21 Cip1 et p16 INK4a (dont dépend le maintien de ce phénotype sénescent), et l’inhibition de la phosphorylation de pRb. L’activation des protéines p21 Cip1 et p16 INK4a réprime respectivement les complexes CDK1/2-cyclines A/E et CDK4/6-cycline D. Cela permet l’activation de la protéine pRb dont la forme non phosphorylée séquestre les facteurs de transcription de la famille E2F et réprime les gènes contrôlant la division cellulaire. Or dans de nombreux cancers, les kinases de contrôle du cycle (telles que la cycline E) et Rb sont fréquemment dérégulées. Cela ouvre un rationnel pour le développement de thérapies pro-sénescence, qui pourraient constituer une approche efficace dans le traitement de nombreux cancers [ 10 ].

En dépit de ce schéma général, selon l’oncogène exprimé ou le modèle cellulaire utilisé, la sénescence peut-être induite sans implication de la réponse aux dommages de l’ADN ou de l’attrition des télomères [ 16 , 17 ]. À titre d’exemple, Jeanblanc et al. ont montré qu’une sénescence induite par C-RAF pouvait s’établir malgré l’inhibition de la signalisation des dommages à l’ADN, suggérant ainsi l’existence d’une voie de déclenchement de la RIS indépendante de la DDR [ 18 ]. De même, Michaloglou et al. ont souligné les différences de réponses cellulaires et de sénescence, suite à l’expression de B-RAF V600E , selon le type de tumeurs bénignes et malignes [ 19 ]. De plus, la sénescence induite par la voie AKT est dépendante de mTOR et ne semble pas nécessiter de réponse aux dommages à l’ADN et dans ce cas, la protéine p16 INK4a reste à des niveaux modestes. En effet, l’hyperactivation d’AKT induit la sénescence en activant la synthèse de p53 via mTORC1 [ 20 ]. D’autres travaux proposent que l’interaction entre MDM2 ( murine double minute 2 ) et p53 serait inhibée (par séquestration de MDM2 dans un complexe comportant des protéines nucléolaires) (pour revue voir [ 14 ]). Ainsi p53 s’accumule, ce qui active à son tour p21 Cip1 , dont dépend l’arrêt prolongé du cycle cellulaire. De nombreux autres acteurs à potentiel oncogénique (tels que c-Myc) peuvent être impliqués dans l’OIS et les études sur ce type de sénescence présentent un certain nombre de particularités selon le variant d’oncogène étudié et le modèle cellulaire utilisé [ 17 ].

Malgré tout, différentes situations de sénescence induite par des oncogènes sont associées à la persistance de dommages qui participent directement ou indirectement à la mise en place de la sénescence.

Le stress oxydant
Des agents oxydants (tels que l’H 2 O 2 , ou les espèces réactives de l’oxygène générées par le métabolisme cellulaire, ROS) sont capables d’induire la sénescence, comme cela a été suggéré par Denham Hartman voici plus de 60 ans dans sa « théorie radicalaire du vieillissement ». Ce stress oxydant va notamment induire des lésions à l’ADN (en plus de l’oxydation des protéines) et potentiellement, selon le dommage oxydatif, un blocage ou un ralentissement des fourches de réplication. Une anomalie de fonctionnement des mitochondries génère une augmentation de radicaux libres dans la cellule et peut induire une sénescence associée à la dysfonction mitochondriale [ 21 ]. Des voies de signalisation vont également pouvoir être activées, telles que p38 MAPK [ 22 ] ou NRF2 ( nuclear factor erythroid-2-related factor 2 ) [ 23 ]. L’ensemble de ces observations place ainsi la sénescence au cœur des théories sur les liens entre radicaux libres et vieillissement cellulaire.
Les agents génotoxiques
Selon leurs mécanismes d’actions, de nombreux agents génotoxiques, tels que les radiations ionisantes ou les molécules chimio-thérapeutiques, vont générer des dommages à l’ADN, une perturbation du cycle cellulaire ou un stress oxydant, et donc potentiellement induire la sénescence. Les inhibiteurs de méthylases de l’ADN ou de déacétylases d’histones peuvent également déclencher la sénescence, en perturbant l’organisation chromatinienne et en déréprimant le suppresseur de tumeur p16 INK4a [ 24 ].
Induction paracrine par les médiateurs du SASP
Une dernière forme d’induction de la sénescence est paracrine. Le SASP d’une cellule primaire en sénescence va en effet être capable d’induire la sénescence au niveau de cellules secondaires voisines. La sénescence paracrine va ainsi favoriser l’amplification du phénotype [ 25 ]. Le SASP, dont le mécanisme sera précisé ci-dessous, est lui aussi associé à la présence ou à la persistance de dommages [ 26 ].

Au sein des divers programmes de sénescence que nous avons mentionnés (attrition des télomères, OIS, stress oxydant, etc.), la réponse aux dommages de l’ADN est souvent une étape centrale dans le contrôle de l’entrée en sénescence ( Figure 2 ) . La présence de cassures doubles brins non résolues au niveau de l’ADN induit en effet le recrutement de la kinase ATM dont l’activation permet la phosphorylation des histones H2AX autour de la cassure ainsi que l’induction de nombreux effecteurs, parmi lesquels, les kinases CHK1 et CHK2, et p53, qui a leur tour activent l’expression de nombreux gènes, notamment ceux permettant la mise en place de la sénescence lorsque l’activation de ces voies de signalisation persiste durablement.

Dommages à l’ADN, ADN cytosoliques, SASP et inflammation

L’un des éléments clés du vieillissement est la sécrétion par les cellules sénescentes de cytokines inflammatoires, facteurs de croissance et autres protéines. Comme nous l’avons décrit précédemment, le SASP a un rôle majeur dans de nombreux désordres associés à la sénescence. Le lien moléculaire entre dommages de l’ADN et ce phénotype pro-inflammatoire a été récemment éclairci. Dans la cellule, l’inflammation est majoritairement initiée via des récepteurs du système immunitaire inné, tels que les nombreux PRR ( pattern recognition receptors) permettant d’identifier des pathogènes. Un senseur de l’ADN, comme le cGAS est capable de détecter de l’ADN présent dans le cytosol, de produire du c-GAMP et d’activer la protéine STING. Cette dernière phosphoryle TBK1 ( TANK binding kinase 1 ) qui à son tour, induit la phosphorylation du facteur de transcription IRF3 ( interferon regulatory factor 3 ) permettant l’activation des gènes codant les interférons de type 1 et la réponse immunitaire innée. Lors de dommages à l’ADN, la présence de fragments d’ADN augmente dans le cytoplasme (probablement produits par les mécanismes de réparation de l’ADN ou le blocage de fourches de réplication) et déclenche une réponse inflammatoire innée via la voie cGAS-STING [ 27 - 29 ] ( → ).

(→) Voir la Synthèse de R. Chanut et V. Petrilli, m/s n° 6-7, juin-juillet 2019, page 527

Dans le cas des cellules sénescentes, il est possible d’observer la présence de fragments de chromatine cytoplasmique (CCF) [ 30 ]. cGAS se localise alors avec les CCF, ce qui mène à la production de cytokines inflammatoires et participe ainsi au SASP ( Figure 3 ) . La délétion de cGAS inhibe la sénescence induite par un stress oxydant [ 31 ] ou par des radiations [ 30 ]. L’ensemble de ces données démontrent que cGAS est essentiel à la production du SASP et à l’induction de la sénescence cellulaire elle-même [ 32 ]. Une réactivation de rétrotransposons de type LINE-1 a également été mise en évidence lors de la sénescence. Ces éléments mobiles sont aussi l’une des sources d’ADN cytosoliques participant à la mise en place du SASP [ 33 ] et au micro-environnement pro-inflammatoire des cellules sénescentes.

Le déclenchement de l’immunité innée, permet le recrutement de cellules immunitaires pour détruire les cellules sénescentes potentiellement porteuses de dommages de l’ADN. Ce phénomène pourrait donc être considéré comme anti-tumoral. Cependant un environnement inflammatoire peut aussi accroître l’agressivité de cellules tumorales par le déclenchement, par exemple, d’une transition épithélio-mésenchymateuse (EMT). L’accumulation de cellules sénescentes au cours du vieillissement normal de l’organisme engendre donc une inflammation chronique et serait à l’origine de nombreuses pathologies liées à l’âge (canitie, athérosclérose, ostéoporose, cataracte, cancer, etc.).

Lamines et sénescence

Un des syndromes de vieillissement prématuré les plus sévères, la Progéria, a été décrit par Jonathan Hutchison en 1886 et par Hasting Gilford en 1887 : il a été nommé syndrome Hutchison Gilford Progeria (HGPS). La mutation dans le gène de la lamine A, responsable de cette pathologie, a été identifiée en 2003 par les groupes de Francis Collins et de Nicolas Levy [ 34 , 35 ]. Cette découverte a permis de mettre en évidence un lien entre les lamines, l’altération de l’enveloppe nucléaire et le vieillissement.

Les lamines
Les lamines sont des filaments intermédiaires de type V, constituants essentiels de la lamina nucléaire, un réseau fibreux bordant la face interne de l’enveloppe nucléaire. La lamina joue un rôle prépondérant dans le maintien de la forme du noyau de la cellule, dans l’organisation du génome et ses fonctions. La famille des lamines est composée de plusieurs protéines : les lamines de types A/C et les lamines de type B. Les lamines A et C codées par le même gène LMNA sont issues d’un épissage alternatif et sont présentes principalement dans les cellules différenciées. La lamine B1 est codée par le gène LMNB1 . Les lamines B2 et B3 sont issues du même gène LMNB2 par épissage alternatif. Les lamines B1 et B2 sont présentes dans tous les types cellulaires. La lamine B3 est spécifique des cellules germinales. Il existe de nombreuses maladies, appelées laminopathies, associées à des dérégulations des lamines A et C. L’une des plus emblématiques est la Progéria, une forme sévère de vieillissement accéléré.
Dérégulation de la lamine A, cas des HGPS
La Progéria est une maladie génétique très rare (1 cas pour 4 à 8 millions de naissances) dont la caractéristique principale est un vieillissement accéléré. Les enfants atteints développent les premiers symptômes pendant leurs premiers mois de vie (défaut de développement, peau avec une apparence de sclérodermie). Habituellement, autour de 18-24 mois après la naissance, il est possible d’observer une alopécie ainsi qu’une apparence caractéristique (petit visage avec une mâchoire en retrait, nez pincé) et un délai de sortie des dents primaires. Plus tard, d’autres symptômes apparaissent : sclérodermie, insuffisance rénale, diminution de la vision et problèmes cardiovasculaires. De plus, une dégénérescence musculo-squelettique entraîne une perte de graisse corporelle et de muscles, des articulations raides, des dislocations de la hanche et d’autres symptômes généralement absents chez les personnes non âgées. Par contre, les individus conservent un développement mental et moteur normal, dû à l’expression d’un micro ARN (miR-9) qui inhibe l’expression de la prélamine A dans le cerveau [ 36 ]. La majorité des patients meurent, durant l’adolescence, d’artériosclérose et de maladies cardiovasculaires. La Progéria est due à une mutation de la lamine A et à l’accumulation d’une forme immature de la protéine. En effet, la pré-lamine A codée par le gène LMNA subit une série de maturations post-transcriptionnelles, dont une carboxyméthylation suivie d’une farnésylation et d’un clivage des 15 derniers acides aminés par l’endoprotéase ZMPSTE24, éliminant ainsi la farnésylation dans la forme mature de la lamine A. La mutation la plus fréquente chez les patients atteints de HGPS est une mutation dans l’exon 11 de la lamine A. Cette mutation entraîne l’utilisation d’un site cryptique d’épissage des ARN messagers, aboutissant à la délétion de 50 acides aminés incluant le site de clivage par la ZMPSTE24. Cela conduit à la production d’une protéine immature mutée et farnésylée appelée progérine ( Figure 4A ) .

Au cours du vieillissement normal ou physiologique, les cellules expriment une forme immature de lamine A [ 37 ], ce qui renforce l’idée que la lamine A immature joue un rôle dans le vieillissement cellulaire, même physiologique.

Lamine A, Progéria, réparation de l’ADN et stabilité télomérique
En plus des déformations de l’enveloppe nucléaire, les cellules déficientes en lamine A montrent des signes d’instabilité génétique, tels que des niveaux élevés de cassures d’ADN (révélées par le marqueur g-H2AX), une augmentation des cassures chromosomiques, ainsi que des défauts au niveau des télomères. Cette instabilité serait en partie due à la déstabilisation d’une protéine clef du mécanisme de religature d’extrémités d’ADN non-homologues (NHEJ), la protéine 53BP1 [ 38 ]. Une diminution d’expression de gènes codant des acteurs essentiels de la recombinaison homologue (RH), autre mécanisme de réparation des cassures double-brin, a aussi été rapportée dans ces cellules [ 38 ]. Par ailleurs, l’expression de prélamine A entraîne une dérégulation de la nucléoporine Nup153, menant à une mauvaise localisation de 53BP1 et ainsi, à une diminution de l’efficacité de réparation [ 39 ]. En ce qui concerne les cellules de patients souffrant d’HGPS (cellules HGPS), l’accumulation de la progérine altère la forme du noyau des cellules, l’expression génique, la régulation épigénétique et cause une instabilité génétique générale. Ainsi, des fibroblastes de patients présentent une accumulation de dommages de l’ADN, une instabilité chromosomique, une sensibilité accrue aux agents génotoxiques, ainsi qu’une réponse aux dommages activée en permanence [ 40 ]. Par ailleurs, les cellules HGPS présenteraient un défaut de recrutement de RAD51 et BRCA1 aux dommages, associé à une diminution d’expression de ces protéines. Ces dernières sont essentielles à la réparation des CDB par recombinaison homologue [ 38 , 40 ]. De plus, des données de la littérature suggèrent l’existence de liens étroits entre les lamines et le maintien des télomères. Ainsi, les cellules déficientes en lamine A ou exprimant la progérine présentent une altération de la localisation et de la mobilité des télomères, ainsi que des dommages télomériques et un raccourcissement de ces derniers [ 41 ]. Une interaction entre la lamine A et la protéine du shelterin, TRF2, a été mise en évidence et jouerait un rôle dans la protection des télomères [ 42 ]. L’expression de la progérine induit la transcription d’ARN non-codants au niveau des télomères. Ces ARN participent à l’activation de la réponse aux dommages et seraient ainsi responsables de différents phénotypes télomériques, de la baisse de prolifération et de l’induction de sénescence des cellules HGPS [ 43 ]. L’activation de la réponse aux dommages de l’ADN aux télomères aurait donc un rôle majeur dans l’étiologie de la pathologie.
Progéria, lamine A et stress oxydant
L’une des sources endogènes d’instabilité génétique est le stress oxydant produit par le métabolisme des mitochondries. Les cellules HGPS présentent des phénotypes caractéristiques de dysfonctions mitochondriales, notamment une augmentation de la production d’espèces réactives de l’oxygène (ROS), ainsi qu’une sensibilité accrue à ces derniers. Des études ont montré qu’un traitement par la N-acétyl-cystéine (NAC), qui diminue les ROS dans des cellules HGPS, provoquait une diminution du niveau basal de dommages de l’ADN ainsi qu’une augmentation de la prolifération cellulaire. Les ROS seraient donc un élément majeur contribuant à l’instabilité dans les cellules HGPS [ 44 ]. De plus, l’expression de la progérine altère la voie NRF2 de détoxification des ROS [ 45 ]. L’enveloppe nucléaire, comportant une concentration élevée d’enzymes de détoxification, pourrait servir de bouclier contre les ROS [ 46 ]. Ainsi, au cours de la sénescence, l’érosion ou la rupture de l’enveloppe nucléaire, induite par l’altération des lamines, pourrait perturber ce bouclier, modifier la détoxification des ROS et les échanges nucléo-cytoplasmiques (aboutissant à la translocation nucléaire de composants tels que des nucléases ou encore des mitochondries) et ainsi aboutir à l’augmentation du stress oxydant nucléaire, ainsi qu’à des dommages de l’ADN et à une instabilité génétique.
Progéria, lamine A, stress réplicatif et inflammation
Les lamines jouent un rôle important dans les mécanismes de réplication de l’ADN. La lamine A stabilise les fourches de réplication bloquées et sa déplétion empêche leur redémarrage [ 47 ]. Dans le cas des cellules HGPS, l’accumulation de progérine induit un effondrement des fourches de réplication en séquestrant le facteur de la réplication, PCNA [ 48 ]. Il a été également proposé que le stress réplicatif induit par la progérine était associé à une diminution de RAD51, nécessaire à la protection et au redémarrage des fourches de réplication. Le stress réplicatif mène à la production de cytokines inflammatoires et d’interférons via la voie cGAS-STING [ 49 ]. Des modèles murins d’accumulation de la prélamine A farnésylée présentent aussi une inflammation accrue dépendante de NF-kB [ 50 ]. L’accumulation de lamine A immature farnésylée au cours du vieillissement physiologique pourrait donc peut-être contribuer aux pathologies inflammatoires liées à l’âge.
Lamine B1 et sénescence : altération des télomères, stress oxydant et défaut de réparation des dommages de l’ADN
Freund et al. ont montré que la sénescence réplicative ou induite par l’expression d’oncogènes ou l’irradiation à forte dose (10 Gy) est associée à une diminution de la lamine B1 [ 51 ]. Shimi et al. ont, quant à eux, montré que la diminution de la lamine B1 induit une sénescence dépendante de p53 [ 52 ]. Une diminution de lamine B1 a été observée après induction de l’autophagie, et l’inhibition de cette autophagie atténuerait l’OIS [ 53 ]. Ceci contribuerait aux liens existant entre autophagie et sénescence. Notre équipe a mis en évidence que des cellules de patients atteints d’ataxie télangiectasie (AT) (mutées dans le gène ATM de signalisation des CDB) présentaient une déformation de l’enveloppe nucléaire et un niveau élevé de lamine B1. L’accumulation de cette protéine est en partie responsable de la sénescence prématurée des cellules AT en culture. Dans ces cellules, le niveau élevé de ROS et l’activation de la p38 MAPK sont responsables de l’accumulation de la lamine B1 [ 54 ]. L’équipe de Dreesen a confirmé qu’un niveau élevé de lamine B1 induit un arrêt de prolifération (encore plus sévère si la surexpression de la lamine B1 est associée à un défaut de la lamine A) et une sénescence prématurée. L’expression de la télomérase hTERT dans les cellules surexprimant la lamine B1 restaure partiellement la prolifération, suggérant que la surexpression de la lamine B1 induit des altérations télomériques [ 55 ]. Ces altérations, dont la cause moléculaire n’est pas encore élucidée, pourraient contribuer à l’établissement de la sénescence observée. Bien que l’induction de sénescence par l’extinction de la lamine B1 soit désormais confirmée par différentes équipes, dont la nôtre, les travaux de l’équipe de Dreesen suggèrent que la diminution de la lamine B1 induirait la sénescence seulement dans des conditions de stress cellulaire (telles qu’une faible densité cellulaire).

L’ensemble de ces données suggèrent donc que la dérégulation des lamines est un élément clé du contrôle de la sénescence. Le ratio lamine B1/lamine A ainsi que l’intégrité de la structure de l’enveloppe et de la matrice nucléaire pourraient être importants dans ce contrôle. Aujourd’hui, la dérégulation de la lamine B1 est considérée comme une des caractéristiques du phénotype sénescent aux côtés d’un signal persistant de réponse aux dommages de l’ADN, d’une augmentation d’expression des inhibiteurs de cyclines p21 Cip1 /p16 INK4a et de l’augmentation de sécrétion des facteurs associés à la sénescence (SASP), entre autres. Il est important de noter ici que la seule diminution de la lamine B1 n’est pas spécifique de la sénescence. En effet, elle peut être également associée à la mort cellulaire par apoptose, la lamine B1 étant aussi une cible des caspases.

Certains auteurs s’interrogent pour savoir s’il convient de considérer les perturbations de la lamine B1 comme une cause ou une conséquence de la sénescence. L’analyse des domaines d’ADN associés aux lamines (LAD) a permis de démontrer que la dérégulation de la lamine B1 dans les cellules sénescentes est associée à des modifications de la chromatine, dont la marque d’histone répressive H3K27me3, liée au contrôle de l’expression des gènes du SASP [ 56 ]. La lamine B1 semble être aussi impliquée dans la réponse au stress oxydant, via notamment son interaction avec le facteur de transcription ubiquitaire OCT1 [ 57 ]. La déplétion de la lamine B1 pourrait en effet déréguler l’expression des gènes de détoxification des ROS sous contrôle d’OCT1 et modifier ainsi la réponse au stress oxydant. Il en résulte que les cellules déficientes en lamine B1 sont plus sensibles à ces stress oxydants. En accord avec ces données, notre équipe a proposé que la surexpression transitoire de la lamine B1 fait partie de la réponse endogène au stress oxydant, de façon dépendante de l’activation de la p38 MAPK [ 54 ]. Une relocalisation d’OCT 1 vers l’enveloppe nucléaire [ 58 ] ainsi qu’une résistance accrue à un stress oxydant induit [ 54 ] ont d’ailleurs été observées en condition de surexpression de la lamine B1. Différents travaux suggèrent, de plus, qu’une dérégulation de la lamine B1 aboutit également à des défauts de réparation de l’ADN, et ainsi, potentiellement, à une instabilité génétique ou à une persistance de dommages. Butin-Israeli et al. ont montré que la diminution de la lamine B1 induit une dérégulation de l’expression de différents gènes impliqués dans la réparation des CDB [ 59 ]. La lamine B1 participerait aussi à la stabilité de la protéine RAD51, impliquée dans la réparation des CDB par recombinaison homologue. Une interaction entre la lamine B1 et la protéine RAD51 a été décrite [ 60 ]. Un défaut de réparation par excision de nucléotide (NER), impliquée dans la prise en charge des dommages induits par les rayons ultra-violets ou par des agents induisant des pontages de l’ADN, a aussi été rapporté [ 61 ]. Cependant, la conséquence de ces altérations, ayant pour origine la diminution de l’expression de la lamine B1, sur l’induction potentielle de la sénescence n’est toutefois pas clairement élucidée. Enfin, l’induction de la voie cGAS par la présence d’ADN dans le cytosol semble être associée, dans différentes conditions, à la présence de micro-noyaux. Le niveau de la lamine B1 ou de la lamine B2 participe à la stabilité de l’enveloppe des micro-noyaux et pourrait ainsi indirectement réguler l’activation de cGAS, de NF-kB, du SASP et l’inflammation.

Les perturbations de l’architecture nucléaire et du réseau de lamines pourraient donc activer des signaux capables de faire rentrer les cellules en sénescence, en altérant leur cycle cellulaire, leur potentiel rédox (oxydo-réduction), et potentiellement, leur stabilité télomérique, ou plus généralement chromosomique, ainsi que leur environnement inflammatoire ( Figure 4B ) . Elles participeraient ainsi au vieillissement de l’organisme.

Conclusions

Nous avons vu que différentes situations de sénescence ou de vieillissement accéléré ont en commun l’activation de la réponse aux dommages de l’ADN, associée ou non à la persistance de dommages télomériques, le stress oxydant, des perturbations de l’enveloppe nucléaire, en particulier une altération des lamines, ainsi que l’induction d’un phénotype inflammatoire. L’ensemble de ces facettes de la sénescence, que l’on pensait potentiellement indépendantes sont en fait toutes associées les unes aux autres. Des recherches fondamentales pour mieux comprendre les mécanismes d’induction de la sénescence sont nécessaires. Il est peu probable que l’on puisse s’opposer un jour totalement au vieillissement au niveau de l’organisme, mais il n’est pas invraisemblable, à l’avenir, de vivre beaucoup plus âgé en meilleure, voire en très bonne santé. De telles recherches permettront de proposer des traitements pour certaines maladies de vieillissement accéléré, telles que la Progéria, et offriront aussi la possibilité de prévenir ou de soulager les différentes maladies liées à l’âge. Cela représente un enjeu sociétal et économique majeur. La découverte, entre autres, de nouveaux sénolytiques permettant d’éliminer les cellules sénescentes, ou de nouveaux modulateurs du SASP, constituent un grand espoir. Toutefois, il convient de ne pas oublier la théorie de la pléiotropie antagoniste et l’action anti-tumorale de la sénescence et du SASP, afin de gérer les potentiels effets indésirables de ce genre d’approches thérapeutiques. Des recherches actives sont donc capitales dans le domaine du vieillissement, mais toujours en lien également avec celui de l’oncologie.

Liens d’intérêt

Les auteurs déclarent n’avoir aucun lien d’intérêt concernant les données publiées dans cet article.

 
Remerciements

Nous tenons à remercier l’ensemble de l’équipe LREV, en particulier Dr Emilie Rass pour ses commentaires sur cette synthèse. L’équipe est soutenue par l’Inserm, le comité régional île-de-France de la Ligue contre le Cancer, AT Europe, le Cancéropôle IDF (AAP Emergence) l’INCA, l’EDF et le programme Radiobiologie du CEA. PF est financée par l’Université Paris Saclay et la Ligue Nationale contre le Cancer et SW est financé par un financement de Thèse CEA DRF « Phare » et la Fondation ARC. AM a été financée par un financement de thèse CEA Irtelis et la Fondation ARC. Les Figures ont été créés avec Biorender.com.

 
Footnotes
1 5-bromo-2’-deoxyuridine/5-éthynyl-2’-deoxyuridine
2 Gène codant la lamine A.
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